La recherche au sein de l'EFS-Alsace est structurée autour de deux unités mixtes INSERM-Université de Strasbourg, l'UMR-S949, « Biologie et pharmacologie des plaquettes sanguines : hémostase, thrombose, transfusion », dirigée par le Dr Christian Gachet et l'UMR-S725, « Biologie des cellules dendritiques humaines » dirigée par le Dr Daniel Hanau. La recherche pratiquée est pluridisciplinaire en relation étroite avec l'Université de Strasbourg, les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg et l'Etablissement Français du Sang.
L'objectif général de l'UMR-S949 est d'étudier les mécanismes moléculaires et cellulaires, normaux et pathologiques, qui sont impliqués dans l'hémostase et la thrombose chez l'homme et dans des modèles expérimentaux chez l'animal. L'UMR-S725 s'intéresse particulièrement au trafic intracellulaire et à la présentation antigénique par les cellules dendritiques.
Une part de l'activité des deux groupes est également consacrée à la recherche et à la médecine transfusionnelles. Le plateau technique est important et comporte, entre autres, deux séquenceurs d'acides nucléiques, un lightcycleur, un laboratoire de protéomique, un système BiAcore, des cytométres de flux, un dispositif de microscopie intravitale pour la thrombose expérimentale chez le petit animal, un laboratoire de microscopie électronique à balayage et à transmission et une animalerie moderne, d'une capacité de 6000 souris environ.
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